RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	EYA2	O00167	538 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	GRM1	Q13255	1194 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	GNAI3	P08754	354 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	CDCA5	Q96FF9	252 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	AIDA	Q96BJ3	306 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	FBXO3	Q9UK99	471 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	HUNK	P57058	714 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	JAG2	Q9Y219	1238 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	WBP1L	Q9NX94	342 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760		F8W031	263 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	CIAO1	O76071	339 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	DLGAP5	Q15398	846 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	SIL1	Q9H173	461 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	FGFR2	P21802	821 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	MAP2K2	P36507	400 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PTPRS-209	ENST00000591760	FOXN1	O15353	648 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	SLC5A1	P13866	664 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	LPIN2	Q92539	896 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	FKBP1B	P68106	108 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	MYO1B	O43795	1136 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	RGMB	Q6NW40	437 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	COPRS	Q9NQ92	184 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	AOC2	O75106	756 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	MTX1	Q13505	466 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	GNAI2	P04899	355 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	SPDYE6	P0CI01	402 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	BCAM	P50895	628 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	NOG	Q13253	232 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	NF2	P35240	595 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.02	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP2B3	Q16720	1220 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC102A	Q96A19	550 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		32	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		32	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	IFFO2	Q5TF58	517 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	CLRN2	A0PK11	232 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	VEZT	Q9HBM0	779 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
PTPRS-209	ENST00000591760	SLC10A3	P09131	477 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	CRK	P46108	304 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	MAST3	O60307	1309 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	CA12	O43570	354 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	LBX1	P52954	281 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	GRIK5	Q16478	980 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PTPRS-209	ENST00000591760	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.92	■■■□□ 2.7

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