RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 VEZTQ9HBM0 779 aa16.66■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 JAG2Q9Y219 1238 aa16.66■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 TRIM17Q9Y577 477 aa16.66■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 MYH3P11055 1940 aa16.65■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 CSF1RP07333 972 aa16.65■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 CFAP100Q494V2 611 aa16.65■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 LINS1Q8NG48 757 aa16.65■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 WNK4Q96J92 1243 aa16.65■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.65■□□□□ 0.26
NEDD4L-232ENST00000591579 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.64■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 WWC1Q8IX03 1113 aa16.64■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.63■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 SPDYE6P0CI01 402 aa16.63■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.63■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.63■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 IREB2P48200 963 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 INHBEP58166 350 aa16.62■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 MAP3K11Q16584 847 aa16.62■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.62■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.62■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 AOX1Q06278 1338 aa16.62■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.62■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 PLIN1O60240 522 aa16.61■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 IL1R1P14778 569 aa16.61■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC27Q2M243 656 aa16.61■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.61■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 FOXO4P98177 505 aa16.6■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 CRHR2Q13324 411 aa16.6■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 RASA3Q14644 834 aa16.6■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.6■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 ERO1AQ96HE7 468 aa16.6■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 POTEFA5A3E0 1075 aa16.59■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 F6X3S4 739 aa16.59■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 GJA5P36382 358 aa16.59■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC184Q52MB2 194 aa16.59■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.59■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.59■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 IL16Q14005 1332 aa16.59■□□□□ 0.25
NEDD4L-232ENST00000591579 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.58■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.58■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.58■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 GCC1Q96CN9 775 aa16.58■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 ELP3Q9H9T3 547 aa16.58■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.58■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 UNCXA6NJT0 531 aa16.57■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TNFAIP1Q13829 316 aa16.57■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.57■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 EFCC1Q9HA90 598 aa16.57■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.57■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 HTTP42858 3142 aa16.57■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.56■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 BEND3Q5T5X7 828 aa16.56■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 OPTNQ96CV9 577 aa16.56■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 PTPN18Q99952 460 aa16.56■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 GRM8O00222 908 aa16.55■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 VAMP4O75379 141 aa16.55■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 GYG1P46976 350 aa16.55■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 SP3Q02447 781 aa16.55■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.55■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.55■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.54■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.54■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.54■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.53■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 VGLL4Q14135 290 aa16.53■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 ARMC5Q96C12 935 aa16.53■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.53■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 A0A1B0GUL6 1792 aa16.53■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 CAP1Q01518 475 aa16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 CCL15Q16663 113 aa16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 OTUD5Q96G74 571 aa16.52■□□□□ 0.24
NEDD4L-232ENST00000591579 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms