RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-210ENST00000591412 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-210ENST00000591412 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 UBE4AQ14139 1066 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 USP44Q9H0E7 712 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 MOB2Q70IA6 237 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 LRRC24Q50LG9 513 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 JAG2Q9Y219 1238 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 UBE2Q2LH0YL09 131 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 GYG1P46976 350 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 DLGAP5Q15398 846 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 CSRNP1Q96S65 589 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 F8W031 263 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 CFAP100Q494V2 611 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 ABHD8Q96I13 439 aa16.71■□□□□ 0.27
CTIF-210ENST00000591412 AOX1Q06278 1338 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 SPDYE6P0CI01 402 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 RNF186Q9NXI6 227 aa16.7■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 PDE8BO95263 885 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 NF2P35240 595 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 METTL24Q5JXM2 366 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.69■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 CLRN2A0PK11 232 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 TRPA1O75762 1119 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 FGFR2P21802 821 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 EYA2O00167 538 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 MYO1BO43795 1136 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 PRKG1Q13976 671 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 MAP3K11Q16584 847 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 KIF16BQ96L93 1317 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 BCAMP50895 628 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.262e-7■■■□□ 17.6
CTIF-210ENST00000591412 GRIK5Q16478 980 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 VPS37DQ86XT2 251 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 FZD1Q9UP38 647 aa16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CTIF-210ENST00000591412 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 TM4SF4P48230 202 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 VEZTQ9HBM0 779 aa16.64■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 CRKP46108 304 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 RASA3Q14644 834 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.63■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 DGKZQ13574 1117 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 SPRYD7Q5W111 196 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-210ENST00000591412 LPIN2Q92539 896 aa16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms