RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	SIN3B	O75182	1162 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	CELA3A	P09093	270 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	COL8A1	P27658	744 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	BHMT	Q93088	406 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	DCAF5	Q96JK2	942 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	RRAGC	Q9HB90	399 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP9B-223	ENST00000590608	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	AMPD1	P23109	780 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	TNFRSF25	Q93038	417 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ARMC5	Q96C12	935 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	OSMR	Q99650	979 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	GRIA4	P48058	902 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	RBL2	Q08999	1139 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	RELL1	Q8IUW5	271 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PSAP	P07602	524 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	CCNJL	Q8IV13	435 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM74	Q96NL1	305 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	SOX18	P35713	384 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	GNB5	O14775	395 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PAGE1	O75459	146 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	KIF4A	O95239	1232 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PF4	P02776	101 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ADH7	P40394	386 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	LIG3	P49916	1009 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	NRL	P54845	237 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	HYAL2	Q12891	473 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	RHOV	Q96L33	236 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	UBP1	Q9NZI7	540 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608		J3QW42	95 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ALB	P02768	609 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	GPLD1	P80108	840 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP11A	P98196	1134 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PLAUR	Q03405	335 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	PWP1	Q13610	501 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	CEP120	Q8N960	986 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	IGFLR1	Q9H665	355 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ATP9B-223	ENST00000590608	NFKBIE	O00221	500 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ENC1	O14682	589 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	GART	P22102	1010 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ETFB	P38117	255 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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