RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC51AQ86UW1 340 aa18.21■□□□□ 0.51
EFTUD2-214ENST00000589769 SP8Q8IXZ3 490 aa18.21■□□□□ 0.51
EFTUD2-214ENST00000589769 OSBP2Q969R2 916 aa18.21■□□□□ 0.51
EFTUD2-214ENST00000589769 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.21■□□□□ 0.51
EFTUD2-214ENST00000589769 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.21■□□□□ 0.51
EFTUD2-214ENST00000589769 M0R2C6 588 aa18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ALDH1B1P30837 517 aa18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 SNED1Q8TER0 1413 aa18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ST18O60284 1047 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 MAP3K12Q12852 859 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 VPS37DQ86XT2 251 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 GGA1Q9UJY5 639 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC27A2O14975 620 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 UFL1O94874 794 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 RNF20Q5VTR2 975 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 RASEFQ8IZ41 740 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 SLX4Q8IY92 1834 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 FOXP2O15409 715 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ZMYM6O95789 1325 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC4A3P48751 1232 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 WASHC4Q2M389 1173 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 H0YIN7 160 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 GPAA1O43292 621 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 MCM2P49736 904 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 VPS53Q5VIR6 699 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-214ENST00000589769 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 IL1R1P14778 569 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 KRT32Q14532 448 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 TTC14Q96N46 770 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 POLLQ9UGP5 575 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 NEK4P51957 841 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CNKSR1Q969H4 720 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CYP21A2P08686 494 aa18.12■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.12■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.12■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 LAMB1P07942 1786 aa18.12■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 PSMA5P28066 241 aa18.11■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 MTFR1LQ9H019 292 aa18.11■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CD209Q9NNX6 404 aa18.11■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.11■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CHD4Q14839 1912 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 MBD4O95243 580 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CHRNA5P30532 468 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ALX1Q15699 326 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 MPNDQ8N594 471 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF384Q8TF68 577 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 AIDAQ96BJ3 306 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 PSME4Q14997 1843 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.09■□□□□ 0.49
EFTUD2-214ENST00000589769 GNAT2P19087 354 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms