RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 FSTL1Q12841 308 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP2B3Q16720 1220 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 DACT2Q5SW24 774 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 LDHDQ86WU2 507 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SSH3Q8TE77 659 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 LPIN2Q92539 896 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 NEUROD6Q96NK8 337 aa8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 F8W031 263 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 EGFRP00533 1210 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L8P0C7I0 530 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 LHX8Q68G74 356 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP85Q6P2H3 762 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTROBQ8N137 903 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 GMLQ99445 158 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL11AQ9H165 835 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.42□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 ADORA1P30542 326 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 GORABQ5T7V8 394 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 OGFOD1Q8N543 542 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CERS5Q8N5B7 392 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GUL7 405 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 APBB1O00213 710 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPA6P17066 643 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.065e-7■■■□□ 16.5
EFTUD2-211ENST00000588374 SCARF1Q14162 830 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 USP48Q86UV5 1035 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 XAGE2Q96GT9 111 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 CRBNQ96SW2 442 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-211ENST00000588374 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 HMMRO75330 724 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 PHKA1P46020 1223 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 HTRA3P83110 453 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIK5Q16478 980 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC102BQ68D86 513 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 DLK2Q6UY11 383 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.39□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAF5O00463 557 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 APLP1P51693 650 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 DLGAP5Q15398 846 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 TNNI3KQ59H18 835 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 WNT10BO00744 389 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 MMP14P50281 582 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP100Q494V2 611 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR108Q9NPR9 543 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-211ENST00000588374 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.5 ms