RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TSHZ3Q63HK5 1081 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-204ENST00000587718 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.58e-8■■■■□ 23.7
CAPNS1-204ENST00000587718 RUFY2Q8WXA3 655 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-204ENST00000587718 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-204ENST00000587718 H7C1W4 665 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.495e-6■■■■□ 22.9
CAPNS1-204ENST00000587718 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 EYA3Q99504 573 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 PGAP2Q9UHJ9 254 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 SGSM2O43147 1006 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSWP56202 376 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 HIP1O00291 1037 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ANO2Q9NQ90 1003 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNQ5Q9NR82 932 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD14O00487 310 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 COPRSQ9NQ92 184 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 SHTN1A0MZ66 631 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 RASSF10A6NK89 507 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA4P34932 840 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 VEGFBP49765 207 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 DPF2Q92785 391 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD50Q92878 1312 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ECE2O60344 883 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 DOK7Q18PE1 504 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAK2O60296 914 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 EVI5LQ96CN4 794 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 RTL9Q8NET4 1388 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAF5O00463 557 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 UFL1O94874 794 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CASP7P55210 303 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CST9Q5W186 159 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPM4Q8TD43 1214 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 GREM2Q9H772 168 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 GGA1Q9UJY5 639 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA6L22H0YM25 854 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CUL4AQ13619 759 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB115Q30KQ5 88 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 MICALL2Q8IY33 904 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 XDHP47989 1333 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 H7C1D1 291 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SASH1O94885 1247 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TICAM2Q86XR7 235 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS12P25398 132 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 NEK4P51957 841 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SNRKQ9NRH2 765 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 VIL1P09327 827 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 AACSQ86V21 672 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 MINPP1Q9UNW1 487 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RFX7Q2KHR2 1363 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-204ENST00000587718 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CSF1RP07333 972 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP2B4P23634 1241 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SAMD7Q7Z3H4 446 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNB2Q92953 911 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 EGFRP00533 1210 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SCN9AQ15858 1988 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 TMX3Q96JJ7 454 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 PALD1Q9ULE6 856 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 MYH3P11055 1940 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 WBP1LQ9NX94 342 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF609O15014 1411 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 FSD2A1L4K1 749 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 G3V3G9 751 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXN1O15353 648 aa30.45■■■□□ 2.47
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