RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-218	ENST00000584243	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	RGS20	O76081	388 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	BMP1	P13497	986 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	SMIM22	K7EJ46	135 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	PLIN1	O60240	522 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	GRIN2C	Q14957	1233 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	FBXL18	Q96ME1	805 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	ST18	O60284	1047 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	STARD3NL	O95772	234 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	A1BG	P04217	495 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	PRMT2	P55345	433 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	LGR6	Q9HBX8	967 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-218	ENST00000584243	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	MAST4	O15021	2626 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	BECN1	Q14457	450 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	SRRD	Q9UH36	339 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	LAMB2	P55268	1798 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	GNAI1	P63096	354 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	PPM1E	Q8WY54	764 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	TRIM47	Q96LD4	638 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	DEFB118	Q96PH6	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	DMD	P11532	3685 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	GNRH1	P01148	92 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	OSBP	P22059	807 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	IFT57	Q9NWB7	429 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	ACACB	O00763	2458 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	BCAR3	O75815	825 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF292	O60281	2723 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	UBXN2A	P68543	259 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	NFE2L2	Q16236	605 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	RAET1E	Q8TD07	263 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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