RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580127.5

MKS1-209, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5

Gene MKS1, Length 843 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-209ENST00000580127 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 FKTNO75072 461 aa22.68■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 IL1R1P14778 569 aa22.68■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 FOXO4P98177 505 aa22.68■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.68■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.68■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.68■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.68■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 PLIN1O60240 522 aa22.67■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 BEND3Q5T5X7 828 aa22.67■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 SPRYD7Q5W111 196 aa22.67■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.66■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.66■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 F8W031 263 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 GRM8O00222 908 aa22.65■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 CFAP100Q494V2 611 aa22.65■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
MKS1-209ENST00000580127 F6X3S4 739 aa22.64■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 ALDH1L1O75891 902 aa22.64■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 TNFAIP1Q13829 316 aa22.64■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 MAP3K11Q16584 847 aa22.64■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 CERS5Q8N5B7 392 aa22.63■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 VEZTQ9HBM0 779 aa22.63■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.62■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 SNAP23O00161 211 aa22.62■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 SPDYE6P0CI01 402 aa22.62■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 UBE4AQ14139 1066 aa22.62■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.62■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.62■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 IFNL1Q8IU54 200 aa22.61■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.6■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 CLRN2A0PK11 232 aa22.6■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.59■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 VPS37DQ86XT2 251 aa22.59■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.59■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 WNK4Q96J92 1243 aa22.59■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.59■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 RASA3Q14644 834 aa22.58■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.58■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
MKS1-209ENST00000580127 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.57■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 TNNI2P48788 182 aa22.57■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.57■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.57■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 ERO1AQ96HE7 468 aa22.56■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.56■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 JAG2Q9Y219 1238 aa22.56■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 ARHGEF6Q15052 776 aa22.55■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.55■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.55■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 FZD1Q9UP38 647 aa22.55■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 GYG1P46976 350 aa22.54■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.54■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.54■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.54■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 TRIM17Q9Y577 477 aa22.54■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.54■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.53■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
MKS1-209ENST00000580127 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 HOOK2Q96ED9 719 aa22.51■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.51■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 CRKP46108 304 aa22.5■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 METTL24Q5JXM2 366 aa22.5■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 SUCLG2Q96I99 432 aa22.5■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.5■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 CSADQ9Y600 493 aa22.5■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
MKS1-209ENST00000580127 MAP3K9P80192 1104 aa22.49■■□□□ 1.19
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