RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DOCK2Q92608 1830 aa31.51■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DEKP35659 375 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC24Q8N4L8 307 aa31.51■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BAG4O95429 457 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NPHP1O15259 732 aa31.49■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPAA1O43292 621 aa31.49■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CTNNA3Q9UI47 895 aa31.49■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FOXP2O15409 715 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDE6AP16499 860 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTMSP20962 102 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GSE1Q14687 1217 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STOX1Q6ZVD7 989 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TPCN1Q9ULQ1 816 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF804BA4D1E1 1349 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ME3Q16798 604 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TCEANC2Q96MN5 208 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF532Q9HCE3 1301 aa31.47■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BRD1O95696 1058 aa31.47■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TM4SF1P30408 202 aa31.47■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNBD1Q8NA66 436 aa31.47■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WWC3Q9ULE0 1092 aa31.47■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa31.46■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GYS1P13807 737 aa31.46■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MAP3K12Q12852 859 aa31.46■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GOLGA6L22H0YM25 854 aa31.45■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC83Q8IWF9 413 aa31.45■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LAMA4Q16363 1823 aa31.45■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRAK2O60296 914 aa31.45■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANKRD2Q9GZV1 360 aa31.44■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMC3Q9UQE7 1217 aa31.44■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A0G2JLW4 131 aa31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 E7EWF7 191 aa31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ST3GAL1Q11201 340 aa31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TTLL5Q6EMB2 1281 aa31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FGAP02671 866 aa31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GYG1P46976 350 aa31.42■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CAVIN4Q5BKX8 364 aa31.42■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.41■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 Q6ZUG5 572 aa31.4■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MAGEB6Q8N7X4 407 aa31.4■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NECAB1Q8N987 351 aa31.39■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AIDAQ96BJ3 306 aa31.38■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SERPINB2P05120 415 aa31.37■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRAPQ13588 217 aa31.37■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXO33Q7Z6M2 555 aa31.37■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VPS37DQ86XT2 251 aa31.37■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GJB2P29033 226 aa31.36■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MCTP1Q6DN14 999 aa31.36■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRP2BPQ9P2M1 347 aa31.36■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ST5P78524 1137 aa31.35■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DENND2AQ9ULE3 1009 aa31.35■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SEMA3EO15041 775 aa31.35■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HAND2P61296 217 aa31.35■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AGXT2Q9BYV1 514 aa31.35■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF213O14771 459 aa31.34■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SYT1P21579 422 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FGD1P98174 961 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BRF1Q92994 677 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STX6O43752 255 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF827Q17R98 1081 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRRC2Q9BYS8 371 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZMYM6O95789 1325 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MBD4O95243 580 aa31.32■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KLRK1P26718 216 aa31.32■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ALX1Q15699 326 aa31.32■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CRY2Q49AN0 593 aa31.32■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 APPP05067 770 aa31.31■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DDR1Q08345 913 aa31.31■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GTF3C6Q969F1 213 aa31.31■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXL16Q8N461 479 aa31.3■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa31.3■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STK3Q13188 491 aa31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms