RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 GYG1P46976 350 aa36.76■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF408Q9H9D4 720 aa36.76■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 FGFR2P21802 821 aa36.74■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 ATG9AQ7Z3C6 839 aa36.74■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 MTMR14Q8NCE2 650 aa36.74■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 GNAI3P08754 354 aa36.73■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 CYP4F22Q6NT55 531 aa36.73■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 WBP1LQ9NX94 342 aa36.73■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 THSD7BQ9C0I4 1608 aa36.73■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 CIAO1O76071 339 aa36.72■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 CDCA5Q96FF9 252 aa36.72■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
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RAB40C-211ENST00000568586 TNNQ9UQP3 1299 aa36.7■■■■□ 3.47
RAB40C-211ENST00000568586 MTX1Q13505 466 aa36.69■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa36.69■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 C2orf69Q8N8R5 385 aa36.69■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 COPRSQ9NQ92 184 aa36.69■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 MAP2K2P36507 400 aa36.68■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 CAVIN4Q5BKX8 364 aa36.68■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 HUNKP57058 714 aa36.67■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 JAG2Q9Y219 1238 aa36.66■■■■□ 3.46
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RAB40C-211ENST00000568586 FKBP1BP68106 108 aa36.65■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 DLGAP5Q15398 846 aa36.65■■■■□ 3.46
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RAB40C-211ENST00000568586 VPS37DQ86XT2 251 aa36.65■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 LPIN2Q92539 896 aa36.65■■■■□ 3.46
RAB40C-211ENST00000568586 FOXN1O15353 648 aa36.63■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 IL15P40933 162 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 BCAMP50895 628 aa36.63■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 CLUAP1Q96AJ1 413 aa36.63■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 SPDYE2BA6NHP3 402 aa36.61■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 F8W031 263 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 SPDYE6P0CI01 402 aa36.61■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 CFAP100Q494V2 611 aa36.61■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 TMEM57Q8N5G2 664 aa36.61■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 SIL1Q9H173 461 aa36.61■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 CEP126Q9P2H0 1117 aa36.61■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 AOC2O75106 756 aa36.6■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 GNAI2P04899 355 aa36.6■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 SLC5A1P13866 664 aa36.6■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 RGMBQ6NW40 437 aa36.6■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa36.6■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 AIDAQ96BJ3 306 aa36.6■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 SERPINA10Q9UK55 444 aa36.6■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
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RAB40C-211ENST00000568586 SRGAP3O43295 1099 aa36.58■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 NOGQ13253 232 aa36.58■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 GRM1Q13255 1194 aa36.58■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.45
RAB40C-211ENST00000568586 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 ZBTB22O15209 634 aa36.57■■■■□ 3.44
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RAB40C-211ENST00000568586 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
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RAB40C-211ENST00000568586 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa36.56■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 ATP2B3Q16720 1220 aa36.55■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa36.55■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 PRDM10Q9NQV6 1147 aa36.55■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 MYO1BO43795 1136 aa36.54■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 IFFO2Q5TF58 517 aa36.54■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 MRIQ9BWK5 157 aa36.54■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa36.54■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
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RAB40C-211ENST00000568586 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 DEFB129Q9H1M3 183 aa36.53■■■■□ 3.44
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RAB40C-211ENST00000568586 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
RAB40C-211ENST00000568586 SLC10A3P09131 477 aa36.5■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 RLBP1P12271 317 aa36.5■■■■□ 3.43
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RAB40C-211ENST00000568586 ZIC5Q96T25 663 aa36.5■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 SPDYE2Q495Y8 402 aa36.49■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa36.48■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 CRKP46108 304 aa36.48■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 WDR66Q8TBY9 1149 aa36.48■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 BEGAINQ9BUH8 593 aa36.48■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 CLRN2A0PK11 232 aa36.47■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 CA12O43570 354 aa36.47■■■■□ 3.43
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