RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 GJA5P36382 358 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 CHRNDQ07001 517 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 OTOFQ9HC10 1997 aa23.35■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 INHBEP58166 350 aa23.35■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 GCKRQ14397 625 aa23.35■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 DLGAP5Q15398 846 aa23.35■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.34■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 CLRN2A0PK11 232 aa23.33■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 TAF5LO75529 589 aa23.33■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
INO80E-212ENST00000568043 F8W031 263 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 PTPN18Q99952 460 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 CACNA1FO60840 1977 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 SLC4A2P04920 1241 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 SPDYE6P0CI01 402 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 KCNJ4P48050 445 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 CRHR2Q13324 411 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 CFAP100Q494V2 611 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 GCC1Q96CN9 775 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 STK31Q9BXU1 1019 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 CCDC184Q52MB2 194 aa23.3■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 JAG2Q9Y219 1238 aa23.3■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.3■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 IL1R1P14778 569 aa23.29■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 ARMC5Q96C12 935 aa23.28■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 UNCXA6NJT0 531 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 FOXO4P98177 505 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 FLIIQ13045 1269 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 ERO1AQ96HE7 468 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 VEZTQ9HBM0 779 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-212ENST00000568043 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.26■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 RASA3Q14644 834 aa23.26■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.26■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 LINS1Q8NG48 757 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 EFCC1Q9HA90 598 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 MYO1BO43795 1136 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 SP3Q02447 781 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 CCDC27Q2M243 656 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 WWC1Q8IX03 1113 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 ELP3Q9H9T3 547 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.22■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 OPTNQ96CV9 577 aa23.22■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 TEPSINQ96N21 525 aa23.22■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 CEP290O15078 2479 aa23.22■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.21■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.21■■□□□ 1.31
INO80E-212ENST00000568043 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 ZNF333Q96JL9 665 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.19■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 F6X3S4 739 aa23.19■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.19■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 PLIN1O60240 522 aa23.18■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.18■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 MRS2Q9HD23 443 aa23.18■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.18■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 IL16Q14005 1332 aa23.17■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 GRIK5Q16478 980 aa23.17■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.17■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 BEND3Q5T5X7 828 aa23.17■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 VAMP4O75379 141 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 VGLL4Q14135 290 aa23.16■■□□□ 1.3
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