RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	CERS5	Q8N5B7	392 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	UTY	O14607	1347 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	PRKG1	Q13976	671 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	UBE4A	Q14139	1066 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	ABHD8	Q96I13	439 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	GYG1	P46976	350 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	MYO1B	O43795	1136 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	METTL24	Q5JXM2	366 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	VPS37D	Q86XT2	251 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	TRPA1	O75762	1119 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP4C-208	ENST00000564966	CFAP100	Q494V2	611 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC24	Q50LG9	513 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	CSRNP1	Q96S65	589 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	VEZT	Q9HBM0	779 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	CLRN2	A0PK11	232 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	CCER2	I3L3R5	266 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	USP44	Q9H0E7	712 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF186	Q9NXI6	227 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	DGKZ	Q13574	1117 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		31.76	■■■□□ 2.68
PPP4C-208	ENST00000564966	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	SPDYE6	P0CI01	402 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	FZD1	Q9UP38	647 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE8B	O95263	885 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PPP4C-208	ENST00000564966	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	AOX1	Q06278	1338 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	EYA2	O00167	538 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	BCAM	P50895	628 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	TNFAIP1	Q13829	316 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	SIL1	Q9H173	461 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	CRK	P46108	304 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	SREBF2	Q12772	1141 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	RASA3	Q14644	834 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC5A1	P13866	664 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D8	O95759	1140 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PPP4C-208	ENST00000564966	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	GRIK5	Q16478	980 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65

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