RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 FSTL1Q12841 308 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHADLQ6NUI6 762 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-209ENST00000561191 H7C1D1 291 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 TIMM10P62072 90 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP17L8P0C7I0 530 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 PHKA1P46020 1223 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 HMMRO75330 724 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 XAGE2Q96GT9 111 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 TNNI3KQ59H18 835 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC102BQ68D86 513 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPR108Q9NPR9 543 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
USP3-AS1-209ENST00000561191 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 GRIK5Q16478 980 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 F8W031 263 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 OGFOD1Q8N543 542 aa22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 PASKQ96RG2 1323 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZBTB22O15209 634 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 HSPA6P17066 643 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 RASGRF1Q13972 1273 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 CNTROBQ8N137 903 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 CEP350Q5VT06 3117 aa22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 SEMA3EO15041 775 aa22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.86■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 APBB1O00213 710 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 MMP14P50281 582 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 GGA3Q9NZ52 723 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.85■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 WNT10BO00744 389 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 SCARF1Q14162 830 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 GORABQ5T7V8 394 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 AOX1Q06278 1338 aa22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRAF5O00463 557 aa22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 PI16Q6UXB8 463 aa22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 RAB11FIP3O75154 756 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 AACSQ86V21 672 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.82■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 MCAMP43121 646 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 APLP1P51693 650 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 CFAP100Q494V2 611 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.81■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADM5C9JUS6 153 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPDYE6P0CI01 402 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRDX5P30044 214 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 DLGAP5Q15398 846 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 DLK2Q6UY11 383 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.8■■□□□ 1.24
USP3-AS1-209ENST00000561191 DCTPP1Q9H773 170 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms