RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC37A3O60309 1634 aa7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 UTRNP46939 3433 aa7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 DISP2A7MBM2 1401 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 E9PSI1 815 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 VPS72Q15906 364 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 PEAK1Q9H792 1746 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 SBF2Q86WG5 1849 aa7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 M0R082 166 aa7.53□□□□□ -1.2
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TMOD3-209ENST00000561136 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 PTMSP20962 102 aa7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF428Q96B54 188 aa7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-209ENST00000561136 STRN4Q9NRL3 753 aa7.53□□□□□ -1.2
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TMOD3-209ENST00000561136 ADGRB1O14514 1584 aa7.52□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 SYT9Q86SS6 491 aa7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 FAM83GA6ND36 823 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 ITSN1Q15811 1721 aa7.51□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.51□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 FAM157BP0CG42 384 aa7.5□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 COBLO75128 1261 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM37O94972 964 aa7.49□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 MDFIQ99750 246 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.49□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 ADGRE1Q14246 886 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 MBTPS1Q14703 1052 aa7.48□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.48□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 AKAP12Q02952 1782 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 DLC1Q96QB1 1528 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF10O15013 1369 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA0232Q92628 1395 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC11Q96J66 1382 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 C9orf172C9J069 976 aa7.47□□□□□ -1.21
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TMOD3-209ENST00000561136 RGL3Q3MIN7 710 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 TP53INP1Q96A56 240 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 SSH2Q76I76 1423 aa7.46□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.46□□□□□ -1.21
TMOD3-209ENST00000561136 EFSO43281 561 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 NID1P14543 1247 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC27Q2M243 656 aa7.46□□□□□ -1.22
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