RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ARX	Q96QS3	562 aa		5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957		A6NJR5	290 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM170B	A6NMN3	283 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL4D	P49703	201 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCL1	Q15111	1095 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	NCAN	O14594	1321 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	USP11	P51784	963 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP27A1	Q02318	531 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM168A	Q92567	244 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC38A3	Q99624	504 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX13	Q9UN79	622 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		5.53	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
AKAP13-223	ENST00000560957	NFKBIE	O00221	500 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRG2	O14669	202 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	FLII	Q13045	1269 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM26D	Q5JW98	314 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	DRD2	P14416	443 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	MESP2	Q0VG99	397 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf46	Q6P387	395 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRA6	Q6PI73	481 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRED2	Q7Z698	418 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM84A	Q96KN4	292 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF10B	O14763	440 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	DLGAP3	O95886	979 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	ZAP70	P43403	619 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	MISP3	Q96FF7	219 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	USP26	Q9BXU7	913 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		5.5	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	FUT4	P22083	530 aa		5.49	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP7	Q14244	749 aa		5.49	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	GLMN	Q92990	594 aa		5.49	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	TOX2	Q96NM4	488 aa		5.49	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		5.49	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	IKBKE	Q14164	716 aa		5.48	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.48	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		5.48	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	ELP3	Q9H9T3	547 aa		5.48	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		5.48	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957		B8ZZF3	427 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	ADH5	P11766	374 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	ACPP	P15309	386 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QL4	Q86Z23	238 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR152	Q8TDT2	470 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	BSND	Q8WZ55	320 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		5.47	□□□□□ -1.53
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	HHIP	Q96QV1	700 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTN3	Q9P232	1028 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		5.46	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		5.46	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms