RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 NF2P35240 595 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXW7Q969H0 707 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 RLBP1P12271 317 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 CHRNDQ07001 517 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 WNT10BO00744 389 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNJ4P48050 445 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-210ENST00000559586 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 SNAP23O00161 211 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 TAF5LO75529 589 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 KLRK1P26718 216 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 MXD3Q9BW11 206 aa25.05■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 GNAI3P08754 354 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 GTF2IP78347 998 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC24Q50LG9 513 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.03■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 MOB2Q70IA6 237 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 PANK1Q8TE04 598 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 CD209Q9NNX6 404 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 SASH1O94885 1247 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 TM4SF4P48230 202 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 SREBF2Q12772 1141 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 MTX1Q13505 466 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 DLGAP5Q15398 846 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 PLIN1O60240 522 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 MYO1BO43795 1136 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 GNAI2P04899 355 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 EYA2O00167 538 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 IL1R1P14778 569 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-210ENST00000559586 UNCXA6NJT0 531 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D8O95759 1140 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 COPRSQ9NQ92 184 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 ALDH1A1P00352 501 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 INHBEP58166 350 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 UBE4AQ14139 1066 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC34A2O95436 690 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKG1Q13976 671 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 METTL24Q5JXM2 366 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR25O00155 361 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 SRGAP3O43295 1099 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 CIAO1O76071 339 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 PDE8BO95263 885 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP3K11Q16584 847 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-210ENST00000559586 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.92■■□□□ 1.58
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