RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-208ENST00000558954 SHTN1A0MZ66 631 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L8P0C7I0 530 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 ADORA1P30542 326 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 TNNI3KQ59H18 835 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 XAGE2Q96GT9 111 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 MXD3Q9BW11 206 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 POTEIP0CG38 1075 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 POTEJP0CG39 1038 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 OGFOD1Q8N543 542 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 JAG2Q9Y219 1238 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 SEMA3EO15041 775 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 PHKA1P46020 1223 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 MMP14P50281 582 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 FSTL1Q12841 308 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 GORABQ5T7V8 394 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC102BQ68D86 513 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 CERS5Q8N5B7 392 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB11FIP3O75154 756 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 C1QTNF8P60827 252 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 CHADLQ6NUI6 762 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB22O15209 634 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 APBB1O00213 710 aa23.21■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.21■■□□□ 1.31
RABGGTA-208ENST00000558954 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.2■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.2■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 EGFRP00533 1210 aa23.19■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 RASGRF1Q13972 1273 aa23.19■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 DOCK2Q92608 1830 aa23.19■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 AACSQ86V21 672 aa23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 MAST3O60307 1309 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 F8W031 263 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 DCTPP1Q9H773 170 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH7P12883 1935 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.15■■□□□ 1.3
RABGGTA-208ENST00000558954 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 GGA3Q9NZ52 723 aa23.14■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 DLGAP5Q15398 846 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 CNTROBQ8N137 903 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA5Q8NB90 893 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 WNT10BO00744 389 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 MCAMP43121 646 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 SCARF1Q14162 830 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.11■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RABGGTA-208ENST00000558954 GRIK5Q16478 980 aa23.11■■□□□ 1.29
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