RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 CCSER2Q9H7U1 834 aa4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 FCGRTP55899 365 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 HYAL2Q12891 473 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 TRAPPC3LQ5T215 181 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 ILDR2Q71H61 639 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 NCAPG2Q86XI2 1143 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 NUDT8Q8WV74 236 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 TCF12Q99081 682 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 ACBD3Q9H3P7 528 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 LIN7BQ9HAP6 207 aa4.78□□□□□ -1.64
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TMOD3-205ENST00000558714 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
TMOD3-205ENST00000558714 APBA3O96018 575 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 CPB1P15086 417 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 CHRNA4P43681 627 aa4.77□□□□□ -1.65
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TMOD3-205ENST00000558714 PERM1Q5SV97 790 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 USP48Q86UV5 1035 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 CCNJLQ8IV13 435 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 CEP120Q8N960 986 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 HHIPQ96QV1 700 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 NACC1Q96RE7 527 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 OSMRQ99650 979 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 DZANK1Q9NVP4 752 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 GGT7Q9UJ14 662 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
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TMOD3-205ENST00000558714 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 TRPA1O75762 1119 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 ELNP15502 786 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 BAG6P46379 1132 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 TNNI2P48788 182 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 SIK1P57059 783 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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TMOD3-205ENST00000558714 MSL1Q68DK7 614 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 ANKRD24Q8TF21 1146 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 DRC1Q96MC2 740 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 CAPN10Q9HC96 672 aa4.76□□□□□ -1.65
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TMOD3-205ENST00000558714 RBSNQ9H1K0 784 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 RASSF4Q9H2L5 321 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 COPRSQ9NQ92 184 aa4.75□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 ITPKAP23677 461 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 GATA4P43694 442 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 WFDC8Q8IUA0 241 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 UBXN4Q92575 508 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 PLD4Q96BZ4 506 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 F6X3S4 739 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 J3QW42 95 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 ADAM23O75077 832 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 GHRHP01286 108 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 CELA3AP09093 270 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 GJA8P48165 433 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 GRIK4Q16099 956 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.73□□□□□ -1.65
TMOD3-205ENST00000558714 FBXO11Q86XK2 927 aa4.73□□□□□ -1.65
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