RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558324.1

HERC1-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene HERC1, Length 828 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-202ENST00000558324 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
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HERC1-202ENST00000558324 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 ZIC5Q96T25 663 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 NOGQ13253 232 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 DLGAP5Q15398 846 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 MOB2Q70IA6 237 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 VPS37DQ86XT2 251 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 KIF16BQ96L93 1317 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 CLRN2A0PK11 232 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 PDE8BO95263 885 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 MMP14P50281 582 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 CFAP100Q494V2 611 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 NF2P35240 595 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 PRKG1Q13976 671 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 CCDC102AQ96A19 550 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 MEIS3Q99687 375 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 SIL1Q9H173 461 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 EYA2O00167 538 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 SLC10A3P09131 477 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 SPDYE6P0CI01 402 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 FKBP1BP68106 108 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.9□□□□□ -0.02
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HERC1-202ENST00000558324 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC1-202ENST00000558324 TNNQ9UQP3 1299 aa14.9□□□□□ -0.02
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HERC1-202ENST00000558324 BCAMP50895 628 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
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HERC1-202ENST00000558324 CA12O43570 354 aa14.88□□□□□ -0.03
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HERC1-202ENST00000558324 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.88□□□□□ -0.03
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HERC1-202ENST00000558324 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 SLC5A1P13866 664 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 TRIM27P14373 513 aa14.87□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 FGFR2P21802 821 aa14.87□□□□□ -0.03
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HERC1-202ENST00000558324 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
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HERC1-202ENST00000558324 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.86□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.86□□□□□ -0.03
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HERC1-202ENST00000558324 TRPA1O75762 1119 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 CRKP46108 304 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 ATP2B3Q16720 1220 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 LPIN2Q92539 896 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 CSRNP1Q96S65 589 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 SRGAP3O43295 1099 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 CIAO1O76071 339 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 GNAI3P08754 354 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 RASA3Q14644 834 aa14.84□□□□□ -0.03
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