RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555117.1

COCH-208, Transcript of cochlin, human

TSL 2

Gene COCH, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COCH-208	ENST00000555117	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.9	■■■□□ 2.06
COCH-208	ENST00000555117	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
COCH-208	ENST00000555117	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		27.9	■■■□□ 2.06
COCH-208	ENST00000555117	SLC10A3	P09131	477 aa		27.89	■■■□□ 2.06
COCH-208	ENST00000555117	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
COCH-208	ENST00000555117	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		27.89	■■■□□ 2.06
COCH-208	ENST00000555117	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		27.88	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.87	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.87	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		27.87	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.86	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.86	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.85	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		27.85	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.85	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.85	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	NF2	P35240	595 aa		27.84	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.84	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	BCAR3	O75815	825 aa		27.83	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	GYG1	P46976	350 aa		27.83	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.83	■■■□□ 2.05
COCH-208	ENST00000555117	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		27.82	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.81	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.81	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.81	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.81	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.81	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.8	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	CSRNP1	Q96S65	589 aa		27.8	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		27.8	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	KIF16B	Q96L93	1317 aa		27.79	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.79	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		27.79	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	MYO1B	O43795	1136 aa		27.78	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	PRKG1	Q13976	671 aa		27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	RNF186	Q9NXI6	227 aa		27.77	■■■□□ 2.04
COCH-208	ENST00000555117	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.76	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	TRPA1	O75762	1119 aa		27.76	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	PDE8B	O95263	885 aa		27.76	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.76	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		27.76	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.76	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.75	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		27.75	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.75	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	AOX1	Q06278	1338 aa		27.74	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.74	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.74	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.74	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		27.73	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		27.72	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	FZD1	Q9UP38	647 aa		27.72	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	TRIM27	P14373	513 aa		27.71	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		27.71	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.71	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	TNN	Q9UQP3	1299 aa		27.71	■■■□□ 2.03
COCH-208	ENST00000555117	EYA2	O00167	538 aa		27.7	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	DGKZ	Q13574	1117 aa		27.69	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		27.69	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	FGFR2	P21802	821 aa		27.68	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	BCAM	P50895	628 aa		27.68	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.67	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	CRK	P46108	304 aa		27.67	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	GRIK5	Q16478	980 aa		27.67	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	MAP3K11	Q16584	847 aa		27.67	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		27.67	■■■□□ 2.02
COCH-208	ENST00000555117	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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