RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	USP44	Q9H0E7	712 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	MOB2	Q70IA6	237 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	GYG1	P46976	350 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	DLGAP5	Q15398	846 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	CSRNP1	Q96S65	589 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936		F8W031	263 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CS-229	ENST00000551936	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		18.21	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	CFAP100	Q494V2	611 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		18.2	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	NF2	P35240	595 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	ABHD8	Q96I13	439 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	RNF186	Q9NXI6	227 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		18.19	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	PDE8B	O95263	885 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	SPDYE6	P0CI01	402 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	TRPA1	O75762	1119 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	AOX1	Q06278	1338 aa		18.17	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	CLRN2	A0PK11	232 aa		18.16	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	PRKG1	Q13976	671 aa		18.16	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		18.16	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	MYO1B	O43795	1136 aa		18.15	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	FGFR2	P21802	821 aa		18.15	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		18.15	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	FZD1	Q9UP38	647 aa		18.15	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		18.15	■□□□□ 0.5
CS-229	ENST00000551936	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	EYA2	O00167	538 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	TM4SF4	P48230	202 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	BCAM	P50895	628 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	GRIK5	Q16478	980 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	VEZT	Q9HBM0	779 aa		18.13	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		18.12	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	CRK	P46108	304 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	DGKZ	Q13574	1117 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	RASA3	Q14644	834 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	KIF16B	Q96L93	1317 aa		18.11	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	SPRYD7	Q5W111	196 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-229	ENST00000551936	LPIN2	Q92539	896 aa		18.09	■□□□□ 0.49

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