RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDSP2-207ENST00000551594 SCNN1DP51172 638 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDSP2-207ENST00000551594 CERS5Q8N5B7 392 aa23.07■■□□□ 1.28
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CTDSP2-207ENST00000551594 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.02■■□□□ 1.28
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CTDSP2-207ENST00000551594 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDSP2-207ENST00000551594 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDSP2-207ENST00000551594 SEMA3EO15041 775 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDSP2-207ENST00000551594 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDSP2-207ENST00000551594 IQCA1LA6NCM1 817 aa23■■□□□ 1.27
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L8P0C7I0 530 aa23■■□□□ 1.27
CTDSP2-207ENST00000551594 EPHX2P34913 555 aa23■■□□□ 1.27
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CTDSP2-207ENST00000551594 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.98■■□□□ 1.27
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CTDSP2-207ENST00000551594 ZAP70P43403 619 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-207ENST00000551594 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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CTDSP2-207ENST00000551594 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.93■■□□□ 1.26
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CTDSP2-207ENST00000551594 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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CTDSP2-207ENST00000551594 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-207ENST00000551594 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-207ENST00000551594 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDSP2-207ENST00000551594 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.92■■□□□ 1.26
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