RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 GRIN3BO60391 1043 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 ADORA1P30542 326 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 MMP14P50281 582 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 BCAMP50895 628 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 SPATA5Q8NB90 893 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 CD209Q9NNX6 404 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 PHKA1P46020 1223 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 GYG1P46976 350 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 JDP2Q8WYK2 163 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 PAG1Q9NWQ8 432 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 MYH7P12883 1935 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 SALL1Q9NSC2 1324 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 PPIP5K2O43314 1243 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 MAP3K12Q12852 859 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 NIM1KQ8IY84 436 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 PSME4Q14997 1843 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 RIMBP2O15034 1052 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 SDSP20132 328 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 MCAMP43121 646 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 RASGRF1Q13972 1273 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 CERS3Q8IU89 383 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 SLF2Q8IX21 1173 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 RILPL2Q969X0 211 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 MAST3O60307 1309 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 DOCK2Q92608 1830 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-220ENST00000550700 SNAP23O00161 211 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 GOLIM4O00461 696 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 CDC45O75419 566 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 LMNB1P20700 586 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 GSTO1P78417 241 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 TNIP1Q15025 636 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 GPR162Q16538 588 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 OLFM4Q6UX06 510 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 FSD1Q9BTV5 496 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 SBF1O95248 1867 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 USP17L3A6NCW0 530 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 USP17L4A6NCW7 530 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 ECE2O60344 883 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 LDHCP07864 332 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 KLRK1P26718 216 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 AOC3Q16853 763 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 NFKBIEO00221 500 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 ZAP70P43403 619 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 UBE3CQ15386 1083 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 MRIQ9BWK5 157 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 RAD50Q92878 1312 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 HAX1O00165 279 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 SCARF1Q14162 830 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 DOK7Q18PE1 504 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 SNRKQ9NRH2 765 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 RAI14Q9P0K7 980 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-220ENST00000550700 ABCF2Q9UG63 623 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms