RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 ERO1AQ96HE7 468 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 BRCA2P51587 3418 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 OGFOD1Q8N543 542 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP2-204ENST00000548823 HOXB7P09629 217 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 PRKG1Q13976 671 aa24.89■■□□□ 1.57
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CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 XDHP47989 1333 aa24.87■■□□□ 1.57
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CTDSP2-204ENST00000548823 ATP2B4P23634 1241 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 MMP14P50281 582 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.85■■□□□ 1.57
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 STK31Q9BXU1 1019 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 LAMB1P07942 1786 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.83■■□□□ 1.57
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC4A2P04920 1241 aa24.82■■□□□ 1.56
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CTDSP2-204ENST00000548823 SZT2Q5T011 3432 aa24.82■■□□□ 1.56
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CTDSP2-204ENST00000548823 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 OTUD5Q96G74 571 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 MXD3Q9BW11 206 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 WNK4Q96J92 1243 aa24.8■■□□□ 1.56
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CTDSP2-204ENST00000548823 MED23Q9ULK4 1368 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP290O15078 2479 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 DLL1O00548 723 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 SP3Q02447 781 aa24.8■■□□□ 1.56
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CTDSP2-204ENST00000548823 FZD1Q9UP38 647 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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CTDSP2-204ENST00000548823 H0YGN5 161 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDSP2-204ENST00000548823 HYPKQ9NX55 129 aa24.79■■□□□ 1.56
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CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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CTDSP2-204ENST00000548823 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDSP2-204ENST00000548823 PDE4AP27815 886 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDSP2-204ENST00000548823 BACH2Q9BYV9 841 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP2-204ENST00000548823 COA1Q9GZY4 146 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP2-204ENST00000548823 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.76■■□□□ 1.55
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP2-204ENST00000548823 G2E3Q7L622 706 aa24.73■■□□□ 1.55
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CTDSP2-204ENST00000548823 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDSP2-204ENST00000548823 SKAP1Q86WV1 359 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDSP2-204ENST00000548823 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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CTDSP2-204ENST00000548823 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDSP2-204ENST00000548823 MYD88Q99836 296 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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CTDSP2-204ENST00000548823 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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