RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 CIAO1O76071 339 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 NEFLP07196 543 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ATP8B2P98198 1209 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 METTL24Q5JXM2 366 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 JDP2Q8WYK2 163 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 KAZALD1Q96I82 304 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 EYA2O00167 538 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 PPIP5K2O43314 1243 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 UFL1O94874 794 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 GPSM2P81274 684 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CHRNDQ07001 517 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 WASHC4Q2M389 1173 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 NIM1KQ8IY84 436 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 COPRSQ9NQ92 184 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 RNF181Q9P0P0 153 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SBF1O95248 1867 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 NFKBIEO00221 500 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 EVI5O60447 810 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 RASSF7Q02833 373 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 UBE4AQ14139 1066 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 IFFO2Q5TF58 517 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CEP85Q6P2H3 762 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SSH3Q8TE77 659 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 CRBNQ96SW2 442 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 SIL1Q9H173 461 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 MED23Q9ULK4 1368 aa6.71□□□□□ -1.33
CS-210ENST00000547912 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 RAB11FIP3O75154 756 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 RGS20O76081 388 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 PDE8BO95263 885 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 SLC5A1P13866 664 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 MFSD10Q14728 455 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 AOC3Q16853 763 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 LRRC24Q50LG9 513 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 OLFM4Q6UX06 510 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 VPS37DQ86XT2 251 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 COA1Q9GZY4 146 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 A0A1B0GUL6 1792 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 SNED1Q8TER0 1413 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 TAF5LO75529 589 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 MAP3K9P80192 1104 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 TNIP1Q15025 636 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 GORABQ5T7V8 394 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 PODNQ7Z5L7 613 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 LPIN2Q92539 896 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 POLLQ9UGP5 575 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 LTBP1Q14766 1721 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 COL4A1P02462 1669 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-210ENST00000547912 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms