RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 H0YIN7 160 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 AOX1Q06278 1338 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 LIG1P18858 919 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PDE1AP54750 535 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZUG5 572 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PP64 1363 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PDE8AO60658 829 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 UBASH3AP57075 661 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PPP2R5BQ15173 497 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 FAM83GA6ND36 823 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM75PA6NK02 468 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ESPNB1AK53 854 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SDSP20132 328 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 HOXC9P31274 260 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KRT79Q5XKE5 535 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 VEZTQ9HBM0 779 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SNRKQ9NRH2 765 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KCNA6P17658 529 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PICALMQ13492 652 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MCTP2Q6DN12 878 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SPECC1Q5M775 1068 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TMC6Q7Z403 805 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 BTG4Q9NY30 223 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 USP25Q9UHP3 1055 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 N4BP3O15049 544 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF165P49910 485 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ATP2A1O14983 1001 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KRT83P78385 493 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC184Q52MB2 194 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SNX21Q969T3 373 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 POLKQ9UBT6 870 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KIFAP3Q92845 792 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM87BQ96K49 555 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 DISP1Q96F81 1524 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SMTNP53814 917 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 GGA1Q9UJY5 639 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC175P0C221 793 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 GNPATO15228 680 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 HSF2BPO75031 334 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SLC8A3P57103 927 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MEIS3Q99687 375 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SPAG5Q96R06 1193 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 PNMA2Q9UL42 364 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF790Q6PG37 636 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 JADE2Q9NQC1 790 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 F8W031 263 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 RUFY3Q7L099 469 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CACNA1FO60840 1977 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 CA8P35219 290 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 NDC80O14777 642 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-226ENST00000546160 TNNT1P13805 278 aa7.23□□□□□ -1.25
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