RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546141.5

GLI1-208, Transcript of GLI family zinc finger 1, human

TSL 5 BASIC

Gene GLI1, Length 3,475 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLI1-208	ENST00000546141	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	STX1A	Q16623	288 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141		M0R2C6	588 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	IQCB1	Q15051	598 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	C5	P01031	1676 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	MAST3	O60307	1309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141		A0A1B0GUL7	405 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	SKIL	P12757	684 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	GPS2	Q13227	327 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	MEGF6	O75095	1541 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CCDC69	A6NI79	296 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	RXRA	P19793	462 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	TPM4	P67936	248 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	STK38	Q15208	465 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ICE2	Q659A1	982 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ADORA1	P30542	326 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	FOXO4	P98177	505 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	SMC2	O95347	1197 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CASQ1	P31415	396 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ELF2	Q15723	593 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PSEN1	P49768	467 aa		11.65	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.65	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	NDUFA8	P51970	172 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	CASP7	P55210	303 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	CPLX1	O14810	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	MYO1C	O00159	1063 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	SCARF1	Q14162	830 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GLI1-208	ENST00000546141	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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