RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 WNT10BO00744 389 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 SASH1O94885 1247 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 GNAI3P08754 354 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 GYG1P46976 350 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 CERS5Q8N5B7 392 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 CAPNS2Q96L46 248 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO3Q9UK99 471 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 CDCA5Q96FF9 252 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 TNNQ9UQP3 1299 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 CIAO1O76071 339 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 FGFR2P21802 821 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 VPS37DQ86XT2 251 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 JAG2Q9Y219 1238 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 HUNKP57058 714 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 DLGAP5Q15398 846 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 WBP1LQ9NX94 342 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 F8W031 263 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 SLC5A1P13866 664 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 GRM1Q13255 1194 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 MTX1Q13505 466 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 LPIN2Q92539 896 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 AIDAQ96BJ3 306 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 SIL1Q9H173 461 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 COPRSQ9NQ92 184 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 MAP2K2P36507 400 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 CFAP100Q494V2 611 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD8-204ENST00000544999 FOXN1O15353 648 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 GNAI2P04899 355 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 BCAMP50895 628 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 SRGAP3O43295 1099 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 FKBP1BP68106 108 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 RGMBQ6NW40 437 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 MYO1BO43795 1136 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 AOC2O75106 756 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 SPDYE6P0CI01 402 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 NF2P35240 595 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 ATP2B3Q16720 1220 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 NOGQ13253 232 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC102AQ96A19 550 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXD8-204ENST00000544999 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 CLRN2A0PK11 232 aa21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 SLC10A3P09131 477 aa21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 RLBP1P12271 317 aa21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 CRKP46108 304 aa21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 GRIK5Q16478 980 aa21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 DEFB129Q9H1M3 183 aa21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 ZBTB22O15209 634 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD8-204ENST00000544999 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms