RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445	CA12	O43570	354 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	SLC10A3	P09131	477 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	IL1R1	P14778	569 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	GYG1	P46976	350 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	MIER1	Q8N108	512 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	SASH1	O94885	1247 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	NF2	P35240	595 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	FKBP1B	P68106	108 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	MYO1B	O43795	1136 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	PDE8B	O95263	885 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	PRKG1	Q13976	671 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	SIL1	Q9H173	461 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	RNF186	Q9NXI6	227 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	AOX1	Q06278	1338 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	EYA2	O00167	538 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	BCAR3	O75815	825 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	SLC5A1	P13866	664 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	BCAM	P50895	628 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	TRPA1	O75762	1119 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	GNAI3	P08754	354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	MEIS3	Q99687	375 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	TM4SF4	P48230	202 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LMO3-222	ENST00000540445	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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