RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 EXOC5O00471 708 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 CLN3Q13286 438 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 PIK3C2GO75747 1445 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.14□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 IGSF3O75054 1194 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 NEUROD1Q13562 356 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 SMIM5Q71RC9 77 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 NLRP3Q96P20 1036 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 COL18A1P39060 1754 aa11.13□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 SV2AQ7L0J3 742 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 AIDAQ96BJ3 306 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 ABCC6O95255 1503 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.12□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.11□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.11□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.11□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L15C9J2P7 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L10C9JJH3 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L12C9JPN9 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L11C9JVI0 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L21D6R901 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L18D6R9N7 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L22D6RA61 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L19D6RCP7 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L20D6RJB6 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 USP17L24Q0WX57 530 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.1□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 ROCK1Q13464 1354 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 MYCP01106 439 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 GNRH1P01148 92 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 POU4F2Q12837 409 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 BCS1LQ9Y276 419 aa11.09□□□□□ -0.63
LMO3-216ENST00000537568 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 NSD2O96028 1365 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 IL2RAP01589 272 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 RNF135Q8IUD6 432 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 ABTB2Q8N961 1025 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 LY75O60449 1722 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 FAM196BA6NMK8 535 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 RASA1P20936 1047 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 CNKSR1Q969H4 720 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 PIK3C2AO00443 1686 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 USP54Q70EL1 1684 aa11.06□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 NCOA4Q13772 614 aa11.06□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 NBPF15Q8N660 670 aa11.06□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.06□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.06□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 A0A0G2JLW4 131 aa11.05□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 UNCXA6NJT0 531 aa11.05□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 DLL1O00548 723 aa11.05□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 SSFA2P28290 1259 aa11.05□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 RNF181Q9P0P0 153 aa11.05□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.05□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 ACEP12821 1306 aa11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 SLIT3O75094 1523 aa11.04□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 CENPCQ03188 943 aa11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 USP4Q13107 963 aa11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 PTK7Q13308 1070 aa11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 DBN1Q16643 649 aa11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 POGKQ9P215 609 aa11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
LMO3-216ENST00000537568 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms