RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	IL1R1	P14778	569 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CRHR2	Q13324	411 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	BRCA2	P51587	3418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	TAF5L	O75529	589 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	FOXO4	P98177	505 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	PSME4	Q14997	1843 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SP3	Q02447	781 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	RASA3	Q14644	834 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198	CENPF	P49454	3210 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM4B-208	ENST00000534198		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	OPTN	Q96CV9	577 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	VAMP4	O75379	141 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	KCNJ4	P48050	445 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	FLII	Q13045	1269 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	GRIK5	Q16478	980 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	MYO1B	O43795	1136 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC184	Q52MB2	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	VGLL4	Q14135	290 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RBM4B-208	ENST00000534198	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198		F6X3S4	739 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198		H0YGN5	161 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198	CTGF	P29279	349 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198	GYG1	P46976	350 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198	GTF2A2	P52657	109 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198	CCL15	Q16663	113 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RBM4B-208	ENST00000534198	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms