RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, human

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP4A-208	ENST00000534106	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	C9orf172	C9J069	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	DYRK3	O43781	588 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	RAD21	O60216	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	LILRB5	O75023	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHMP4A-208	ENST00000534106	PXDN	Q92626	1479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NUP155	O75694	1391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ITGAE	P38570	1179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	MCM6	Q14566	821 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ALG2	Q9H553	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	COG6	Q9Y2V7	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	RAC1	P63000	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	UNC13B	O14795	1591 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NID1	P14543	1247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	EPHA4	P54764	986 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	HIF1A	Q16665	826 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	MDFI	Q99750	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NAIP	Q13075	1403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ELN	P15502	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	KCNQ4	P56696	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	TYRO3	Q06418	890 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	GPR162	Q16538	588 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHMP4A-208	ENST00000534106	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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