RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
TSTA3-216ENST00000533817 H7C1D1 291 aa18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 JAG2Q9Y219 1238 aa18.33■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 ZBTB22O15209 634 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 EGFRP00533 1210 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 PHKA1P46020 1223 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 FSTL1Q12841 308 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 TNNI3KQ59H18 835 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 XAGE2Q96GT9 111 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.32■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 USP17L8P0C7I0 530 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC102BQ68D86 513 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 CHADLQ6NUI6 762 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.31■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.3■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.29■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 SEMA3EO15041 775 aa18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 MMP14P50281 582 aa18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 RHPN1Q8TCX5 695 aa18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 RAB11FIP3O75154 756 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 RASGRF1Q13972 1273 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 GRIK5Q16478 980 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 OGFOD1Q8N543 542 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.27■□□□□ 0.52
TSTA3-216ENST00000533817 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 AAMPQ13685 434 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 DCTPP1Q9H773 170 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.26■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 F8W031 263 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 APBB1O00213 710 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 GORABQ5T7V8 394 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 PASKQ96RG2 1323 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 AACSQ86V21 672 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 CNTROBQ8N137 903 aa18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 WNT10BO00744 389 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 SCARF1Q14162 830 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 GGA3Q9NZ52 723 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.23■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.22■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 HSPA6P17066 643 aa18.22■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 MCAMP43121 646 aa18.22■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 CFAP100Q494V2 611 aa18.22■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 PI16Q6UXB8 463 aa18.22■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 PRDX5P30044 214 aa18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 DLGAP5Q15398 846 aa18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 SPATA5Q8NB90 893 aa18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.21■□□□□ 0.51
TSTA3-216ENST00000533817 CRKP46108 304 aa18.2■□□□□ 0.5
TSTA3-216ENST00000533817 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TSTA3-216ENST00000533817 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms