RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.08■■■□□ 2.41
PACSIN3-204ENST00000528201 PRDM10Q9NQV6 1147 aa30.07■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 HDAC9Q9UKV0 1011 aa30.06■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 F8W031 263 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 MMP14P50281 582 aa30.05■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 METTL24Q5JXM2 366 aa30.05■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 RGMBQ6NW40 437 aa30.05■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 AOX1Q06278 1338 aa30.03■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM205AQ6ZU69 1335 aa30.03■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 MOB2Q70IA6 237 aa30.03■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO33Q7Z6M2 555 aa30.02■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 TSKSQ9UJT2 592 aa30.02■■■□□ 2.4
PACSIN3-204ENST00000528201 PDE8BO95263 885 aa30.01■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 NOGQ13253 232 aa30.01■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.01■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 MEIS3Q99687 375 aa30.01■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 DLGAP5Q15398 846 aa30■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 TNNQ9UQP3 1299 aa30■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF16BQ96L93 1317 aa29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 EYA2O00167 538 aa29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 CFAP100Q494V2 611 aa29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 BCAR3O75815 825 aa29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 FGFR2P21802 821 aa29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 BEGAINQ9BUH8 593 aa29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC10A3P09131 477 aa29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 SPDYE6P0CI01 402 aa29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 FKBP1BP68106 108 aa29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 GRIK5Q16478 980 aa29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.96■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 BCAMP50895 628 aa29.96■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC102AQ96A19 550 aa29.96■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.95■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 CLRN2A0PK11 232 aa29.95■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM27P14373 513 aa29.95■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.95■■■□□ 2.39
PACSIN3-204ENST00000528201 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 SIL1Q9H173 461 aa29.94■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 CAPN15O75808 1086 aa29.93■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 VPS37DQ86XT2 251 aa29.93■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.93■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.92■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 FZD1Q9UP38 647 aa29.91■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 CA12O43570 354 aa29.9■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.9■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 CIAO1O76071 339 aa29.89■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 PRKG1Q13976 671 aa29.89■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.89■■■□□ 2.38
PACSIN3-204ENST00000528201 LPIN2Q92539 896 aa29.88■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.88■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 CSRNP1Q96S65 589 aa29.88■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 VEZTQ9HBM0 779 aa29.88■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.88■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 NF2P35240 595 aa29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO3Q9UK99 471 aa29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC5A1P13866 664 aa29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 CRKP46108 304 aa29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 COPRSQ9NQ92 184 aa29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO1BO43795 1136 aa29.85■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 GNAI3P08754 354 aa29.85■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.85■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 RASA3Q14644 834 aa29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF186Q9NXI6 227 aa29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.84■■■□□ 2.37
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.84■■■□□ 2.37
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