RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 GLTPD2A6NH11 291 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 DOCK2Q92608 1830 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 RAD17O75943 681 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 PSMD14O00487 310 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 MMP14P50281 582 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 GTF2IP78347 998 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 RASGRF1Q13972 1273 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 DACT2Q5SW24 774 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 MYH7P12883 1935 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 FBXW7Q969H0 707 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 IGSF3O75054 1194 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA5Q8NB90 893 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 LNPKQ9C0E8 428 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 DPF2Q92785 391 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 BCL11AQ9H165 835 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 ERC2O15083 957 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 ATP5JP18859 108 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 MX1P20591 662 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 MCAMP43121 646 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 AK9Q5TCS8 1911 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRK-218ENST00000525459 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 MAST3O60307 1309 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 AOX1Q06278 1338 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 YY1P25490 414 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 GMLQ99445 158 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 STAP2Q9UGK3 403 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 OGFOD1Q8N543 542 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 SCNN1DP51172 638 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 SCARF1Q14162 830 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 USP17L8P0C7I0 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 PDE1AP54750 535 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 CERS5Q8N5B7 392 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 HAUS7Q99871 368 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 HACL1Q9UJ83 578 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 JAG2Q9Y219 1238 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 H7C1D1 291 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRK-218ENST00000525459 ZAP70P43403 619 aa22.77■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 PI16Q6UXB8 463 aa22.77■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.77■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 MICALL2Q8IY33 904 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 ABCF2Q9UG63 623 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 SLF2Q8IX21 1173 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 MXD3Q9BW11 206 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 SNRKQ9NRH2 765 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms