RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	ATG3	Q9NT62	314 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB39	O15060	712 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	NLRP12	P59046	1061 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC16	Q8NEE8	873 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	MEGF11	A6BM72	1044 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	PCSK2	P16519	638 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	CES1	P23141	567 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	SSFA2	P28290	1259 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	PREP	P48147	710 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	PMEPA1	Q969W9	287 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	PIM2	Q9P1W9	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	RXRB	P28702	533 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	FZD5	Q13467	585 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	CNTN3	Q9P232	1028 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL6	Q8N531	539 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	MTMR7	Q9Y216	660 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP2B4	P23634	1241 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	XKR5	Q6UX68	686 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	NFKBIE	O00221	500 aa		6.51	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	NFKBIB	Q15653	356 aa		6.51	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	TRPA1	O75762	1119 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	USP11	P51784	963 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	IKBKE	Q14164	716 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	C8orf34	Q49A92	452 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	SGO2	Q562F6	1265 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	PAOX	Q6QHF9	649 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	ATCAY	Q86WG3	371 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	ABI1	Q8IZP0	508 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	RGS22	Q8NE09	1264 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	BSND	Q8WZ55	320 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	ACPP	P15309	386 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	FOSL1	P15407	271 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	EDEM1	Q92611	657 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL18	Q96ME1	805 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	SOX13	Q9UN79	622 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	F13B	P05160	661 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	NXPE3	Q969Y0	559 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	ASIC4	Q96FT7	647 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	OSMR	Q99650	979 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	USP26	Q9BXU7	913 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	SEPT3	Q9UH03	358 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	HHIP	Q96QV1	700 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP26A1	O43174	497 aa		6.46	□□□□□ -1.38
FAM49B-222	ENST00000522702	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.46	□□□□□ -1.38
FAM49B-222	ENST00000522702	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
FAM49B-222	ENST00000522702	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		6.46	□□□□□ -1.38
FAM49B-222	ENST00000522702	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM49B-222	ENST00000522702	TIAF1	O95411	115 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM49B-222	ENST00000522702	PDGFA	P04085	211 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM49B-222	ENST00000522702	EDN3	P14138	238 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM49B-222	ENST00000522702	DRD2	P14416	443 aa		6.45	□□□□□ -1.38

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