RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 EYA2O00167 538 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 IGSF3O75054 1194 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 STK38Q15208 465 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.1■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 FOXP2O15409 715 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 C8orf76Q96K31 380 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.09■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 BIN1O00499 593 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 WASHC4Q2M389 1173 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TMEM200B-202ENST00000521452 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.08■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 OGFRQ9NZT2 677 aa25.08■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 A0A1W2PQ27 194 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 A0A1W2PQ64 194 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 A0A1W2PQD8 194 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 A1BGP04217 495 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 EVCP57679 992 aa25.07■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 NEDD4P46934 1319 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 SMC2O95347 1197 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 FGAP02671 866 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 ADORA1P30542 326 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 SPTLC2O15270 562 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 PRC1O43663 620 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 IFNKQ9P0W0 207 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 FBXL16Q8N461 479 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.05■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 GSDMDP57764 484 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF28PB7ZC32 967 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 GORABQ5T7V8 394 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.04■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF202O95125 648 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 SCARF1Q14162 830 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 ISM2Q6H9L7 571 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 TMC6Q7Z403 805 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 TICAM2Q86XR7 235 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF18AQ8NI77 898 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 CPLX1O14810 134 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 ANTXR2P58335 489 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC6O95255 1503 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 YEATS4O95619 227 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 PI16Q6UXB8 463 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM200B-202ENST00000521452 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 CIAO1O76071 339 aa25.01■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 XAGE2Q96GT9 111 aa25.01■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.01■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 ELF2Q15723 593 aa25■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 C19orf44Q9H6X5 657 aa25■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 NPHP1O15259 732 aa25■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 PFKFB1P16118 471 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 ZAP70P43403 619 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 ANO1Q5XXA6 986 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 KCND1Q9NSA2 647 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 NCAPHQ15003 741 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 BRAPQ7Z569 592 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
TMEM200B-202ENST00000521452 AIFM3Q96NN9 605 aa24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms