RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP2-225ENST00000513069 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP2-225ENST00000513069 PRDX5P30044 214 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.72■□□□□ 0.59
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SH3BP2-225ENST00000513069 RHPN1Q8TCX5 695 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 CRBNQ96SW2 442 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-225ENST00000513069 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
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