RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
ALYREF-203ENST00000511412 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
ALYREF-203ENST00000511412 MOB2Q70IA6 237 aa31.08■■■□□ 2.57
ALYREF-203ENST00000511412 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa31.08■■■□□ 2.57
ALYREF-203ENST00000511412 UBE4AQ14139 1066 aa31.07■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 DLGAP5Q15398 846 aa31.07■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 ARAP2Q8WZ64 1704 aa31.07■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 MROH5Q6ZUA9 1318 aa31.05■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 F8W031 263 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 JAG2Q9Y219 1238 aa31.05■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 UBE2Q2LH0YL09 131 aa31.04■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 ALDH1L2Q3SY69 923 aa31.04■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 MTMR14Q8NCE2 650 aa31.04■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 CDCA7LQ96GN5 454 aa31.04■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD44Q8N8A2 993 aa31.03■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 CSRNP1Q96S65 589 aa31.03■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 SMC4Q9NTJ3 1288 aa31.02■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 RNF186Q9NXI6 227 aa31.02■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa31.02■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 FAM205AQ6ZU69 1335 aa31.01■■■□□ 2.56
ALYREF-203ENST00000511412 MYO1BO43795 1136 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
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ALYREF-203ENST00000511412 CFAP100Q494V2 611 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 TRPA1O75762 1119 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 ARMC9Q7Z3E5 817 aa31■■■□□ 2.55
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ALYREF-203ENST00000511412 SPDYE6P0CI01 402 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 MCOLN1Q9GZU1 580 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 DEFB129Q9H1M3 183 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 METTL24Q5JXM2 366 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 MFSD14BQ5SR56 506 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 USP44Q9H0E7 712 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 PRKG1Q13976 671 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC24Q50LG9 513 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 CLRN2A0PK11 232 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 CCER2I3L3R5 266 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 DGKZQ13574 1117 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 VPS37DQ86XT2 251 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 VEZTQ9HBM0 779 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-203ENST00000511412 SSC5DA1L4H1 1573 aa30.95■■■□□ 2.54
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ALYREF-203ENST00000511412 KLHDC4Q8TBB5 520 aa30.94■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 PDE8BO95263 885 aa30.93■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
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ALYREF-203ENST00000511412 VGLL2Q8N8G2 317 aa30.93■■■□□ 2.54
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ALYREF-203ENST00000511412 FBXO33Q7Z6M2 555 aa30.91■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 AOX1Q06278 1338 aa30.91■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 LDLRAD1Q5T700 205 aa30.9■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 FZD1Q9UP38 647 aa30.9■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
ALYREF-203ENST00000511412 SREBF2Q12772 1141 aa30.88■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 MAP3K11Q16584 847 aa30.88■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa30.88■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
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ALYREF-203ENST00000511412 TM4SF4P48230 202 aa30.87■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 TNFAIP1Q13829 316 aa30.87■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 SPDYE2Q495Y8 402 aa30.87■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa30.87■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 KIF16BQ96L93 1317 aa30.87■■■□□ 2.53
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ALYREF-203ENST00000511412 CRKP46108 304 aa30.86■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 RASA3Q14644 834 aa30.86■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 MYH13Q9UKX3 1938 aa30.86■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 LAMB1P07942 1786 aa30.85■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 EYA2O00167 538 aa30.85■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 SPRYD7Q5W111 196 aa30.85■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 FGFR2P21802 821 aa30.84■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 BCAMP50895 628 aa30.83■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 OTOFQ9HC10 1997 aa30.83■■■□□ 2.53
ALYREF-203ENST00000511412 UNCXA6NJT0 531 aa30.82■■■□□ 2.52
ALYREF-203ENST00000511412 TBC1D8O95759 1140 aa30.82■■■□□ 2.52
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