RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.97■□□□□ 0.63
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS37DQ86XT2 251 aa18.95■□□□□ 0.62
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC10A3P09131 477 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPDYE6P0CI01 402 aa18.91■□□□□ 0.62
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 JAG2Q9Y219 1238 aa18.91■□□□□ 0.62
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC5A1P13866 664 aa18.88■□□□□ 0.61
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.88■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.88■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MOB2Q70IA6 237 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MEIS3Q99687 375 aa18.87■□□□□ 0.61
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSRNP1Q96S65 589 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRIQ9BWK5 157 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSKSQ9UJT2 592 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLRN2A0PK11 232 aa18.85■□□□□ 0.61
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAPN15O75808 1086 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCAR3O75815 825 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM27P14373 513 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIL1Q9H173 461 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VEZTQ9HBM0 779 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COPRSQ9NQ92 184 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UNCXA6NJT0 531 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRKP46108 304 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF186Q9NXI6 227 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTX1Q13505 466 aa18.83■□□□□ 0.6
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