RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 C12orf49Q9H741 205 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRK-215ENST00000498284 AK5Q9Y6K8 562 aa7.61□□□□□ -1.19
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PTPRK-215ENST00000498284 LINC01387J3KSC0 135 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRK-215ENST00000498284 CTSHP09668 335 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRK-215ENST00000498284 ELNP15502 786 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRK-215ENST00000498284 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-215ENST00000498284 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PTPRK-215ENST00000498284 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRK-215ENST00000498284 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 USP31Q70CQ4 1352 aa7.49□□□□□ -1.21
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