RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 PCNTO95613 3336 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC5A1P13866 664 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 BCAMP50895 628 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 GGA3Q9NZ52 723 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.98■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 MS4A1P11836 297 aa20.98■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 MMP14P50281 582 aa20.98■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CST9Q5W186 159 aa20.98■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 DLK2Q6UY11 383 aa20.98■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.98■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 ADM5C9JUS6 153 aa20.97■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 F8W031 263 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 ATP2B3Q16720 1220 aa20.97■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.97■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 WNT10BO00744 389 aa20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 ATP8B2P98198 1209 aa20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 SULF1Q8IWU6 871 aa20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 CNTNAP1P78357 1384 aa20.95■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 TFCP2Q12800 502 aa20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 POLA2Q14181 598 aa20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.94■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 JMYQ8N9B5 988 aa20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 SSH3Q8TE77 659 aa20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 COG6Q9Y2V7 657 aa20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.93■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 TIMM10P62072 90 aa20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 DLGAP5Q15398 846 aa20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 RASSF10A6NK89 507 aa20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 ADORA1P30542 326 aa20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 GRIK5Q16478 980 aa20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 VEGFBP49765 207 aa20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP100Q494V2 611 aa20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 CDCA5Q96FF9 252 aa20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1B0GUL7 405 aa20.89■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 PHKA1P46020 1223 aa20.89■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.89■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP85Q6P2H3 762 aa20.89■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.89■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.88■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 SPDYE6P0CI01 402 aa20.88■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.88■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 XAGE2Q96GT9 111 aa20.88■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.88■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 PDE3AQ14432 1141 aa20.87■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC102BQ68D86 513 aa20.87■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.87■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.87■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 AOX1Q06278 1338 aa20.86■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.86■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.86■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 CLRN2A0PK11 232 aa20.85■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 MYO1BO43795 1136 aa20.85■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 CRKP46108 304 aa20.85■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.85■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.85■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.85■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 SEMA3EO15041 775 aa20.84■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 CAPNS2Q96L46 248 aa20.84■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.84■□□□□ 0.93
KCNQ1-205ENST00000496887 HUNKP57058 714 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms