RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.87□□□□□ -0.51
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PTPRC-212ENST00000491302 LIG3P49916 1009 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRC-212ENST00000491302 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRC-212ENST00000491302 ELOA3Q8NG57 546 aa11.87□□□□□ -0.51
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PTPRC-212ENST00000491302 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.83□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 IGF1RP08069 1367 aa11.82□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 LMNB2Q03252 620 aa11.82□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.81□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.81□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 PF4P02776 101 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 NME2P22392 152 aa11.8□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.8□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 IKBKEQ14164 716 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 PAGE1O75459 146 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRC-212ENST00000491302 SOGA3Q5TF21 947 aa11.78□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.78□□□□□ -0.52
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PTPRC-212ENST00000491302 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 H3BRJ5 948 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.76□□□□□ -0.53
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