RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 FANCGO15287 622 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 ATP1A3P13637 1013 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 PLA2G4AP47712 749 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 NCAPHQ15003 741 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 TIGD1Q96MW7 591 aa11.9□□□□□ -0.5
VWA3B-217ENST00000489630 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 LAMA4Q16363 1823 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 NFAT5O94916 1531 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PQ27 194 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PQ64 194 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PQD8 194 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.89□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 FANCCQ00597 558 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 DPF2Q92785 391 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 EPC1Q9H2F5 836 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF202O95125 648 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 CYP2C19P33261 490 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 NLRP12P59046 1061 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 NEUROD6Q96NK8 337 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 USP54Q70EL1 1684 aa11.88□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 SPTLC2O15270 562 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 UBXN4Q92575 508 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 VGLL3A8MV65 326 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 KIF28PB7ZC32 967 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TPM4P67936 248 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 C8orf76Q96K31 380 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 CARD6Q9BX69 1037 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 PAG1Q9NWQ8 432 aa11.87□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 PFKFB1P16118 471 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 KCNJ6P48051 423 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 MNS1Q8NEH6 495 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TMX1Q9H3N1 280 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 MAST3O60307 1309 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM232C9JQI7 657 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 NRDCO43847 1150 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TADA3O75528 432 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 HAND2P61296 217 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 TIMM10P62072 90 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 CNPY4Q8N129 248 aa11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 M0R2C6 588 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF790Q6PG37 636 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 NEK11Q8NG66 645 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 A0A087WZG4 1122 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 YEATS4O95619 227 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 SERPINC1P01008 464 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 UBASH3AP57075 661 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 PSME1Q06323 249 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 LMBR1LQ6UX01 489 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 PALLDQ8WX93 1383 aa11.85□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 GOLGA8BA8MQT2 603 aa11.84□□□□□ -0.51
VWA3B-217ENST00000489630 CAPN2P17655 700 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms