RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486234.1

AUP1-208, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene AUP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-208ENST00000486234 PHKA1P46020 1223 aa16.03■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.03■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 GPATCH3Q96I76 525 aa16.03■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 DBNDD2Q9BQY9 259 aa16.03■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.03■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 CHD4Q14839 1912 aa16.03■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 IGHDP01880 384 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 OGFOD1Q8N543 542 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 FBXW7Q969H0 707 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 GMLQ99445 158 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 GPRC5DQ9NZD1 345 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 HACL1Q9UJ83 578 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.02■□□□□ 0.16
AUP1-208ENST00000486234 SPEF2Q9C093 1822 aa16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 USP17L8P0C7I0 530 aa16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 MRIQ9BWK5 157 aa16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 UTRNP46939 3433 aa16.01■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 SCNN1DP51172 638 aa16■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 RASGRF1Q13972 1273 aa16■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 SPATA5Q8NB90 893 aa16■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 MAST3O60307 1309 aa15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ATP5JP18859 108 aa15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 NUCB1Q02818 461 aa15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 RRAGCQ9HB90 399 aa15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.98■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 EPHX2P34913 555 aa15.98■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.98■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 MICALL2Q8IY33 904 aa15.98■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.98■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 POTECB2RU33 542 aa15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ERC2O15083 957 aa15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 MCAMP43121 646 aa15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 SLF2Q8IX21 1173 aa15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.97■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 A0A1B0GUL6 1792 aa15.96■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 EPS15P42566 896 aa15.96■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 CERS5Q8N5B7 392 aa15.96■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.96■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.96■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.96■□□□□ 0.15
AUP1-208ENST00000486234 TIAM2Q8IVF5 1701 aa15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 WDR90Q96KV7 1748 aa15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 STAP2Q9UGK3 403 aa15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 MX1P20591 662 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 GSTO1P78417 241 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 LDHDQ86WU2 507 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 HAUS7Q99871 368 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 MXD3Q9BW11 206 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 JAG2Q9Y219 1238 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 AOX1Q06278 1338 aa15.94■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 KIF3CO14782 793 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 LDHCP07864 332 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 SCARF1Q14162 830 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 DLGAP5Q15398 846 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 TICAM2Q86XR7 235 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 TEKT1Q969V4 418 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 LNPKQ9C0E8 428 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.93■□□□□ 0.14
AUP1-208ENST00000486234 ABCF2Q9UG63 623 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms