RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485272.5

RIPPLY3-202, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RIPPLY3, Length 2,005 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-202ENST00000485272 CASC1Q6TDU7 716 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 GPATCH3Q96I76 525 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 UFL1O94874 794 aa14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 SCARF1Q14162 830 aa14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 MPNDQ8N594 471 aa14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 AOX1Q06278 1338 aa14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 ERC2O15083 957 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 ATP5JP18859 108 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 GGA1Q9UJY5 639 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 C6orf229H3BNL8 230 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 SDSP20132 328 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 PI16Q6UXB8 463 aa14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 ATP2B4P23634 1241 aa14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 DDIT3P35638 169 aa14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 SNRKQ9NRH2 765 aa14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 SNED1Q8TER0 1413 aa14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 MCAMP43121 646 aa14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 RILPL2Q969X0 211 aa14.58□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 RIMBP2O15034 1052 aa14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 SYT17Q9BSW7 474 aa14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 BCS1LQ9Y276 419 aa14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.57□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 RASGRF1Q13972 1273 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 RABEP1Q15276 862 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 HAUS7Q99871 368 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 ZAP70P43403 619 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 DMTNQ08495 405 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 VPS37DQ86XT2 251 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 GBP4Q96PP9 640 aa14.56□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 MYH7P12883 1935 aa14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.55□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 WASHC4Q2M389 1173 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CCDC93Q567U6 631 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 GOLIM4O00461 696 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 SPATA5Q8NB90 893 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 KIF2CQ99661 725 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 MED23Q9ULK4 1368 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 SCN9AQ15858 1988 aa14.54□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 REC8O95072 547 aa14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 JAG2Q9Y219 1238 aa14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CHGBP05060 677 aa14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 DOK7Q18PE1 504 aa14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CNTROBQ8N137 903 aa14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 CD209Q9NNX6 404 aa14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RIPPLY3-202ENST00000485272 AOC3Q16853 763 aa14.52□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.52□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 EVI5LQ96CN4 794 aa14.52□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 DOCK2Q92608 1830 aa14.52□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 PSMD1Q99460 953 aa14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 EYA3Q99504 573 aa14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3-202ENST00000485272 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms