RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-208ENST00000484908 KAZALD1Q96I82 304 aa22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 RNF186Q9NXI6 227 aa22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 PTPRCP08575 1304 aa22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRPA1O75762 1119 aa22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 DLGAP5Q15398 846 aa22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 UBE4AQ14139 1066 aa22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLFN5Q08AF3 891 aa22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 DGKZQ13574 1117 aa22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 F8W031 263 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 CFAP100Q494V2 611 aa22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 JAG2Q9Y219 1238 aa22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1-208ENST00000484908 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 MYO1BO43795 1136 aa22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 SPDYE6P0CI01 402 aa22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 GYG1P46976 350 aa22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRKG1Q13976 671 aa22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.55■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 TM4SF4P48230 202 aa22.54■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.54■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP44Q9H0E7 712 aa22.54■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 CLRN2A0PK11 232 aa22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAP3K11Q16584 847 aa22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 LRRC24Q50LG9 513 aa22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 SREBF2Q12772 1141 aa22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 METTL24Q5JXM2 366 aa22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 VEZTQ9HBM0 779 aa22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1-208ENST00000484908 PDE8BO95263 885 aa22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 RGS19P49795 217 aa22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 VPS37DQ86XT2 251 aa22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 UNCXA6NJT0 531 aa22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 SPRYD7Q5W111 196 aa22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 FZD1Q9UP38 647 aa22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 AOX1Q06278 1338 aa22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 TBC1D8O95759 1140 aa22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 TNFAIP1Q13829 316 aa22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 RASA3Q14644 834 aa22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 LAMB1P07942 1786 aa22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 CCER2I3L3R5 266 aa22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 CRKP46108 304 aa22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 INHBEP58166 350 aa22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 KIF16BQ96L93 1317 aa22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1-208ENST00000484908 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1-208ENST00000484908 EYA2O00167 538 aa22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms