RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 UBE4AQ14139 1066 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 MOB2Q70IA6 237 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 CSRNP1Q96S65 589 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 RNF186Q9NXI6 227 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.659e-7■■■□□ 17.1
ACTB-212ENST00000484841 DGKZQ13574 1117 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 UTYO14607 1347 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 SLFN5Q08AF3 891 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 VPS37DQ86XT2 251 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 CERS5Q8N5B7 392 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 JAG2Q9Y219 1238 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 PRKG1Q13976 671 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 CFAP100Q494V2 611 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-212ENST00000484841 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 KAZALD1Q96I82 304 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 GYG1P46976 350 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 METTL24Q5JXM2 366 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 VEZTQ9HBM0 779 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 CLRN2A0PK11 232 aa25.29■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.29■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.29■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.29■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 SPDYE6P0CI01 402 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 SREBF2Q12772 1141 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ACTB-212ENST00000484841 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 PDE8BO95263 885 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 TNFAIP1Q13829 316 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 LRRC24Q50LG9 513 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 USP44Q9H0E7 712 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 TM4SF4P48230 202 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 CCER2I3L3R5 266 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 TNNI2P48788 182 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 RASA3Q14644 834 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D8O95759 1140 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 SPRYD7Q5W111 196 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 FZD1Q9UP38 647 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 UNCXA6NJT0 531 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 CRKP46108 304 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K11Q16584 847 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 ALDH1A1P00352 501 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 SLC5A1P13866 664 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 INHBEP58166 350 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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