RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 CAPN15O75808 1086 aa16.35■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 MAP2K2P36507 400 aa16.35■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 UBE4AQ14139 1066 aa16.35■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 BCAR3O75815 825 aa16.34■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
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HPS1-211ENST00000478087 GRIK5Q16478 980 aa16.34■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 METTL24Q5JXM2 366 aa16.34■□□□□ 0.21
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HPS1-211ENST00000478087 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.34■□□□□ 0.21
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HPS1-211ENST00000478087 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.34■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.34■□□□□ 0.21
HPS1-211ENST00000478087 UBE2Q2LH0YL09 131 aa16.33■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.33■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.33■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.32■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 BCAMP50895 628 aa16.31■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.31■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 CLRN2A0PK11 232 aa16.3■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.3■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.3■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.3■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 FGFR2P21802 821 aa16.29■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 NOGQ13253 232 aa16.29■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.29■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.28■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 SLC10A3P09131 477 aa16.28■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 SPDYE6P0CI01 402 aa16.28■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
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HPS1-211ENST00000478087 VPS37DQ86XT2 251 aa16.28■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.28■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 CCDC102AQ96A19 550 aa16.28■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.28■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.28■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 TRIM27P14373 513 aa16.27■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.27■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 CSRNP1Q96S65 589 aa16.27■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HPS1-211ENST00000478087 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.26■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 VEZTQ9HBM0 779 aa16.26■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 KIF16BQ96L93 1317 aa16.25■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 FKBP1BP68106 108 aa16.25■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.25■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 TRPA1O75762 1119 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 RNF186Q9NXI6 227 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 CRKP46108 304 aa16.23■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 RASA3Q14644 834 aa16.23■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 LPIN2Q92539 896 aa16.23■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.23■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 AK9Q5TCS8 1911 aa16.22■□□□□ 0.19
HPS1-211ENST00000478087 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
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